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    Published on 19.12.2014 by Equipo GNOSS

    SADI - Semantic Automated Discovery and Integration

    Are you a data or service provider?

    SADI is a framework for discovery of, and interoperability between, distributed data and analytical resources. It combines simple, stateless, GET/POST-based Web Services with standards from the W3C Semantic Web initiative. The objective of SADI is to make it easy for data and analytical tool providers to quickly make their resources available on the Semantic Web with minimal disruption to their usual practices. SADI is quite a distinct “technology” in that there’s nothing to it… literally! SADI avoids creating new technologies or non-standard Web “infrastructure” (e.g., message formats). It simply defines an open set of best-practices and conventions, within the spectrum of existing standards, that allow for a high degree of semantic discoverability and interoperability between participating services. Moreover, many of these integrative behaviors have not been observed before in any precedent, distributed system!

    Do you need data?

    Though you will probably never even know you are using it, SADI was designed with you in mind! SADI enables the data sources and analytical websites that you use every day to provide their resources to you in a much more intuitive way. This means that the software you use to interact with these resources will also become “smarter” when it is SADI-enabled, because SADI is specifically designed to “think” the way you “think”. If there’s a resource that you would like to see available through SADI, contact us, or contact your IT service provider. If there’s a software tool that you think would benefit from being SADI-enabled, tell us about it, or write to the provider of that tool with your request! The open-source SADI project provides a place where participants can submit software and/or ontological tools that adhere to these conventions, and can be used by others. This helps to “spread the word” and make it easier for new resources to become semantically interoperable.

    Development of SADI is generously supported by CANARIE, the Heart and Stroke Foundation of B.C. and Yukon, the Canadian Institutes of Health Research, and Microsoft Research.

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    Shared on 12.3.2013 by Equipo GNOSS

    OpenClinical: Ontologies

    Ontology - the "science of being" - typically has different meanings in different contexts. Webster's Dictionary defines ontology as:

     

    a branch of metaphysics relating to the nature and relations of being

    a particular theory about the nature of being and the kinds of existence

    Several philosophers - from Aristoteles (4th Century BC) to Leibniz (1646-1716), and more recently the 19th Century major ontologists like Bolzano, Brentano, Husserl and Frege - have provided criteria for distinguishing between different kind of objects (a.g. concrete vs. abstract) and the relations between them.

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    Published on 5.12.2012 by Equipo GNOSS

    Case Study: A Semantic Web Content Repository for Clinical Research

    Esta Web nos presenta un ejemplo de caso de studio de la empresa Cleveland Clinic en el área investigación clínica.

    En ella se explica el resultado de un proyecto entre el equipo de bioinformática y Cycorp Inc.  en el cual se ha desarrollado una interfaz de consulta del estado de técnica clínicas que se construye a través de fragmentos de consulta en lenguaje natural impulsados ​​por el lenguaje interacciones con un investigador clínico . Estos fragmentos de la consulta se transforman en una secuencia de fragmentos de consulta SPARQL optimizadas que son evaluados contra un servicio SPARQL remoto.

    El servicio soporta un conjunto de datos RDF que incluyen desde procedimientos cardiovasculares hasta enfermedades infecciosas. La traducción desde RDF a lenguaje natural es posible gracias a una asignación cuidadosamente realizada de una ontología OWL. Esto se ha traducido en un lenguaje común muy expresivo para el dominio de la cirugía torácica y cardiovascular.

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    Published on 20.11.2012 by Equipo GNOSS

    SWAT4LS workshop

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    SWAT4LS  workshop

    SWAT4LS es un workshop cuyo fin es la presentación y discusión de las ventajas y los límites de aplicaciónes web basadas ​​en sistemas de información y tecnologías semánticas en Informática Biomédica y Biología Computacional.

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    Published on 5.11.2012 by Equipo GNOSS

    Web semántica y ontologías de dominio. Un enfoque para la organización y gestión de recursos gubernamentales

    Proyecto en el área de Web semántica cuyo objetivo fue  generar un modelo conceptual para la integración de ontologías de dominio referentes a medio ambiente y recursos naturales, educación, economía y salud.

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    Published on 1.10.2012 by Equipo GNOSS

    Charla impartida en la conferencia “The 2012 Semantic Tech & Business Conference” en San Francisco, CA, EE.UU. (celebrada entre el 3 y 7 de junio de 2012).

    En ella Eric Little, PhD, Orbis Technologies, Inc. nos habla de cómo el uso de tecnologías de la Web semántica, en especial ontologías y reglas ontológicas pueden ayudar a solucionar distintos problemas en el sector de la Salud.

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    Published on 4.9.2012 by Equipo GNOSS

    Charla impartida en la conferencia The 2012 Semantic Tech & Business Conference en San Francisco, CA, EE.UU. (celebrada entre el 3 y 7 de junio de 2012).

    En ella Erich A Gombocz de O Informatics, Inc. nos muestra como las tecnologías semánticas pueden ayudar a luchar contra enfermedades infeciosas desarrollando sistemas biológicos que comprendan los patógenos microbianos.

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    Published on 3.9.2012 by Equipo GNOSS

    Charla impartida en la conferencia The 2012 Semantic Tech & Business Conference en San Francisco, CA, EE.UU. (celebrada entre el 3 y 7 de junio de 2012).

    En ella Jyotishman Pathak de Mayo Clinic College of Medicine nos el proyecto Linked Clinical Data (LCD) Project, proyecto tiene como objetivo principal investigar nuevas tecnologías de la Web Semántica para desarrollo de un marco ontología que use EHRs para analizar fenotipos multifactoriales.

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    Published on 11.7.2012 by Equipo GNOSS

    Knowledge Management in Health Care Using Semantic Web Technology

    Este post explica como el uso de bases de datos semánticas facilita la estructuración y consulta de información sobre medicamentos y salud.

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    Published on 3.7.2012 by Equipo GNOSS

    Bioportal

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    Bioportal

    BioPortal es un repositorio de ontologías biomédicas. Entre sus características podemos incluir la exploración, búsqueda y exploración de ontologías. Además, BioPortal contiene asignaciones entre ontologías y facilita el entendimiento de estas asignaciones.

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